数万年前，人类刚刚进入了石器时代，这时候人类的发展已经非常迅速了。
而人类和神奇宝贝之间的战争也随处可见，然而也并不是每个地方都是如此，也有很多地方的人类和神奇宝贝是相互共存的。
在那时，强大的神奇宝贝几乎随处可见，人类处于劣势，好在人类当中也是有强者的。
强大的训练家，强大的能力者，其中能力者是当时最备受推崇的一个职业，被人类称之为半神者，拥有可以和强大神奇宝贝对战的实力。
和主世界相同，数万年前的能力者们，实力都很强大，最差的也达到了等级三的异能力者级别。
等级五的超能力者更是不少，人类初步拥有了和神奇宝贝战斗的资本。
只是有些地方也是有人类和神奇宝贝和平相处的情况存在，所以当时的人类被分成了两个阵营。
半神部落和联盟部落，这两个部落也是人类阵营中最强的两个部落。
当时手无寸铁的人类，必须要加入某个部落才能够生存下来，因为古代是弱肉强食的时代，就算在如今，一个不小心在野外也会被神奇宝贝攻击，更别提古代了。
半神部落，这个部落是由一群能力者统治的部落，里面等级制度分明，因为有着强大的能力者带领，所以半神部落的人类觉得世界不应该存在神奇宝贝。
人类才是食物链最顶端的生命，所以在半神部落中是根本看不到神奇宝贝的。
联盟部落，这个部落和半神部落则完全的相反，联盟部落属于和平主义者，是由多个小部落组成的大部落，在这里你可以看到人类和神奇宝贝们和平相处的温馨场面。
所以半神部落和联盟部落一直都是敌对的，半神部落因为有着强大的能力者保护，所以是最安全的人类部落。
只是想受到保护，也就同样要受到管制，相比起来，联盟部落就不同了，虽然也有着能力者的保护，但数量和半神部落相差太多。
所以经常受到野生神奇宝贝的攻击，甚至有时候还会受到半神部落的进攻，半神部落一直都想把联盟部落吞掉，因为他们觉得联盟部落的出现根本没有必要。
随着时间的推移，联盟部落和半神部落发生了多次的战争，依靠能力者和神奇宝贝，联盟部落始终败而不灭。
虽然战争输多赢少，但半神部落始终无法彻底摧毁联盟部落，其原因就是因为联盟部落除了有能力者以外，还有神奇宝贝们的帮助。
当时的时代是人类与人类的战争，因为人类发展的迅速，所以很多部落都已经可以抵御住野生神奇宝贝们的攻击了。